| |
|
|
 | Acesso ao texto completo restrito à biblioteca da Embrapa Mandioca e Fruticultura. Para informações adicionais entre em contato com cnpmf.biblioteca@embrapa.br. |
|
Registro Completo |
|
Biblioteca(s): |
Embrapa Mandioca e Fruticultura. |
|
Data corrente: |
19/01/2017 |
|
Data da última atualização: |
08/02/2017 |
|
Tipo da produção científica: |
Artigo em Periódico Indexado |
|
Autoria: |
CASTRO, J. A.; OLIVEIRA, E. J. de; JESUS, O. N. de; SOARES, T. L.; MARGARIDO, G. R. A. |
|
Afiliação: |
J. A. CASTRO, UFRB; EDER JORGE DE OLIVEIRA, CNPMF; ONILDO NUNES DE JESUS, CNPMF; T. L. SOARES; G. R. A. MARGARIDO, ESALQ. |
|
Título: |
Molecular markers for conservation genetic resources of fourPassiflora species. |
|
Ano de publicação: |
2016 |
|
Fonte/Imprenta: |
Scientia Horticulturae, v., 212, p. 251-261, 2016. |
|
ISSN: |
0304-4238 |
|
Idioma: |
Inglês |
|
Conteúdo: |
tThe aim of this study was to use microsatellite markers (SSR) for the characterization of the Passifloraspecies and to verify the effect of random selection of individuals in parameters that characterize thegenetic variability of germplasm for conservation purposes. Four species, Passiflora edulis f. flavicarpaDegener, P. cincinnata Mast., P. alata Curtis and P. setacea D.C., were evaluated. For each species tworandom samples were evaluated, one consisting of 60 plants (S60) and the other of 10 plants (S10)randomly selected from the S60. Initially, the S10 and S60 were used to calculate the genetic parametersof number of alleles, expected and observed heterozygosity, effective population size, inbreeding andpolymorphic information content based on 40 microsatellite markers developed for P. edulis and 20 for P.alata. Further bootstrap analysis was performed to identify the minimum number of individuals neededto represent the variability of each Passiflora species from a range of 2 to 59. The number of polymorphicmicrosatellites was 15, 9, 6 and 2 on P. edulis f. flavicarpa, P. cincinnata, P. alata and P. setacea, respectively.The allelic loss due to the under-representation of the samples was 19 (30%), 16 (43%) and nine (39%)alleles, respectively, for P. edulis f. flavicarpa, P. cincinnata and P. alata. No allelic loss was observed forP. setacea, probably because only two polymorphic microsatellites were identified. In general, there aredifferences between S10 and S60 because of lost genetic variability on S10, indicating that the use of these10 individuals to represent the Passiflora species is insufficient for long-term preservation. In contrast,the bootstrap analysis revealed that the stability of the genetic parameters due to the increase in samplesize was close to 30, 23, 25 and 24 individuals for P. cincinnata, P. edulis f. flavicarpa, P. setacea and P. alata,respectively. The difference of genetic estimates between samples S10 and S60 demonstrated that 23?30individuals are the minimum range of population to represent the Passiflora species studied. This studymay optimize the strategies for conservation the Passiflora germplasm avoiding the under-representationof samples and consequent loss of genetic variability during sexual propagation. MenostThe aim of this study was to use microsatellite markers (SSR) for the characterization of the Passifloraspecies and to verify the effect of random selection of individuals in parameters that characterize thegenetic variability of germplasm for conservation purposes. Four species, Passiflora edulis f. flavicarpaDegener, P. cincinnata Mast., P. alata Curtis and P. setacea D.C., were evaluated. For each species tworandom samples were evaluated, one consisting of 60 plants (S60) and the other of 10 plants (S10)randomly selected from the S60. Initially, the S10 and S60 were used to calculate the genetic parametersof number of alleles, expected and observed heterozygosity, effective population size, inbreeding andpolymorphic information content based on 40 microsatellite markers developed for P. edulis and 20 for P.alata. Further bootstrap analysis was performed to identify the minimum number of individuals neededto represent the variability of each Passiflora species from a range of 2 to 59. The number of polymorphicmicrosatellites was 15, 9, 6 and 2 on P. edulis f. flavicarpa, P. cincinnata, P. alata and P. setacea, respectively.The allelic loss due to the under-representation of the samples was 19 (30%), 16 (43%) and nine (39%)alleles, respectively, for P. edulis f. flavicarpa, P. cincinnata and P. alata. No allelic loss was observed forP. setacea, probably because only two polymorphic microsatellites were identified. In general, there aredifferences between S10 and S60 becaus... Mostrar Tudo |
|
Palavras-Chave: |
Passionfruit. |
|
Thesagro: |
Maracujá. |
|
Categoria do assunto: |
-- |
|
Marc: |
LEADER 02875naa a2200205 a 4500
001 2061183
005 2017-02-08
008 2016 bl uuuu u00u1 u #d
022 $a0304-4238
100 1 $aCASTRO, J. A.
245 $aMolecular markers for conservation genetic resources of fourPassiflora species.$h[electronic resource]
260 $c2016
520 $atThe aim of this study was to use microsatellite markers (SSR) for the characterization of the Passifloraspecies and to verify the effect of random selection of individuals in parameters that characterize thegenetic variability of germplasm for conservation purposes. Four species, Passiflora edulis f. flavicarpaDegener, P. cincinnata Mast., P. alata Curtis and P. setacea D.C., were evaluated. For each species tworandom samples were evaluated, one consisting of 60 plants (S60) and the other of 10 plants (S10)randomly selected from the S60. Initially, the S10 and S60 were used to calculate the genetic parametersof number of alleles, expected and observed heterozygosity, effective population size, inbreeding andpolymorphic information content based on 40 microsatellite markers developed for P. edulis and 20 for P.alata. Further bootstrap analysis was performed to identify the minimum number of individuals neededto represent the variability of each Passiflora species from a range of 2 to 59. The number of polymorphicmicrosatellites was 15, 9, 6 and 2 on P. edulis f. flavicarpa, P. cincinnata, P. alata and P. setacea, respectively.The allelic loss due to the under-representation of the samples was 19 (30%), 16 (43%) and nine (39%)alleles, respectively, for P. edulis f. flavicarpa, P. cincinnata and P. alata. No allelic loss was observed forP. setacea, probably because only two polymorphic microsatellites were identified. In general, there aredifferences between S10 and S60 because of lost genetic variability on S10, indicating that the use of these10 individuals to represent the Passiflora species is insufficient for long-term preservation. In contrast,the bootstrap analysis revealed that the stability of the genetic parameters due to the increase in samplesize was close to 30, 23, 25 and 24 individuals for P. cincinnata, P. edulis f. flavicarpa, P. setacea and P. alata,respectively. The difference of genetic estimates between samples S10 and S60 demonstrated that 23?30individuals are the minimum range of population to represent the Passiflora species studied. This studymay optimize the strategies for conservation the Passiflora germplasm avoiding the under-representationof samples and consequent loss of genetic variability during sexual propagation.
650 $aMaracujá
653 $aPassionfruit
700 1 $aOLIVEIRA, E. J. de
700 1 $aJESUS, O. N. de
700 1 $aSOARES, T. L.
700 1 $aMARGARIDO, G. R. A.
773 $tScientia Horticulturae$gv., 212, p. 251-261, 2016.
Download
Esconder MarcMostrar Marc Completo |
|
Registro original: |
Embrapa Mandioca e Fruticultura (CNPMF) |
|
|
Biblioteca |
ID |
Origem |
Tipo/Formato |
Classificação |
Cutter |
Registro |
Volume |
Status |
URL |
Voltar
|
|
|
| Registros recuperados : 23 | |
| 1. |  | MOLLINARI, M.; MARGARIDO, G. R. A.; GARCIA, A. A. F. Comparação dos algoritmos delineação rápida em cadeia e seriação, para a construção de mapas genéticos. Pesquisa Agropecuária Brasileira, Brasília, DF, v. 43, n. 4, p. 505-512, abr. 2008 Título em inglês: Comparison of algorithms rapid chain delineation and seriation, for the construction of genetic linkage maps.| Biblioteca(s): Embrapa Unidades Centrais. |
|    |
| 4. | | OLIVEIRA, J. C. de; FORMIGHIERI, E. F.; GARCIA, A. L. B.; MARGARIDO, G. R. A.; CAMPOS, T. de. Caracterização funcional do transcriptoma de amendoim forrageiro. In: SEMINÁRIO DA EMBRAPA ACRE DE INICIAÇÃO CIENTÍFICA E PÓS-GRADUAÇÃO, 5., 2022, Rio Branco, AC. O papel da tecnologia agrícola na segurança alimentar: anais. Rio Branco, AC: Embrapa Acre, 2023. p. 129-133. Pôster. (Embrapa Acre. Eventos técnicos & científicos, 5). Editores técnicos: Rodrigo Souza Santos; Fabiano Marçal Estanislau.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Acre. |
| |
| 6. | | SOUZA, A. P. de; OLIVEIRA, F. A.; VIGNA, B. B. Z.; MARGARIDO, G. R. A.; HOHENLOHE, P. A. Genome-wide polymorphisms in polyploids Paspalum species from Plicatula group. In: INTERNATIONAL FORAGE TURF BREEDING CONFERENCE, 2019, Lake Buena Vista, Florida. Proceedings... Lake Buena Vista, Florida: University of Florida, 2019. p.15| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Pecuária Sudeste. |
|  |
| 7. | | ROSÁRIO, M. F.; MARGARIDO, G. R. A.; BOSCHIERO, C.; MOURA, A. S. A. M. T.; LEDUR, M. C.; COUTINHO, L. L.; GARCIA, A. A. F. Precision of distances and ordering of microsatellite markers in consensus linkage maps of chromosomes 1,3 and 4 from two reciprocal chicken populations using bootstrap sampling. Genetics and Molecular Research, v. 9, n. 3, p. 1357-1376, 2010. Disponível em: . Acesso em: 18 fev 2011. Projeto/Plano de Ação: 02.09.70.600-01.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: B - 1 |
| Biblioteca(s): Embrapa Suínos e Aves. |
|  |
| 8. | | ROSÁRIO, M. F.; MARGARIDO, G. R. A.; BOSCHIERO, C.; MOURA, A. S. A. M. T.; LEDUR, M. C.; GARCIA, A. A. F.; COUTINHO, L. L. Precision of distances and orders of microsatellite markers in a genetic linkege map of chromosome 1 using bootstrap resampling. In: WORLD CONGRESS ON GENETICS APPLIED TO LIVESTOCK PRODUCTION, 9. 2010, Leipzig. Abstracts. Leipzig: Gesellschaft fur Tierzuchtwissenschaften, 2010. p.316 Projeto: 01.06.01.006| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Suínos e Aves. |
| |
| 9. | | ROSÁRIO, M. F.; MARGARIDO, G. R. A.; BOSCHIERO, C.; NONES, K.; MOURA, A. S. A. M. T.; LEDUR, M. C.; COUTINHO, L. L.; GARCIA, A. A. F. Mapa consenso brasileiro do cromossomo 1 oriundo de cruzamentos recíprocos entre linhagens de corte e postura. In: CONFERÊNCIA FACTA DE CIÊNCIA E TECNOLOGIA AVÍCOLAS, 27., 2009, Porto Alegre. Anais [dos] trabalhos de pesquisa José Maria Lamas de Silva. [Campinas]: FACTA, 2009. Projeto/Plano de Ação: 01.02.10.210-10. Publicado em CD-ROM (CD00156).| Tipo: Artigo em Anais de Congresso / Nota Técnica |
| Biblioteca(s): Embrapa Suínos e Aves. |
| |
| 10. | | ROSÁRIO, M. F.; MARGARIDO, G. R. A.; LEDUR, M. C.; MOURA, A. S. A. M. T.; GARCIA, A. A. F.; COUTINHO, L. L. Mapa consenso brasileiro do cromossomo 4 da galinha associado a intervalos de confiança de distâncias e ordens de locos microssatélites In: CONGRESSO BRASILEIRO DE GENÉTICA, 55, 2009, Águas de Lindóia. Anais... Águas de Lindóia:SBG, 2009. p. 153. Projeto/Plano de Ação: 01.06.106.03-05| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Suínos e Aves. |
| |
| 12. | | COUTINHO, L. L.; MOROSINI, N. S.; CESAR, A. S. M.; POLETI, M. D.; REGITANO, L. C. de A.; MARGARIDO, G. R. A. Identification and characterization of euchromatic regions associated with gene expression and intramuscular fat in Nelore cattle. Journal of Animal Science, v. 96, suppl. S3, p. 233-234, 2019.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: A - 1 |
| Biblioteca(s): Embrapa Pecuária Sudeste. |
| |
| 14. | | OLIVEIRA, A. A. de; GUIMARAES, L. J. M.; GUIMARÃES, C. T.; GUIMARAES, P. E. de O.; PINTO, M. de O.; PASTINA, M. M.; MARGARIDO, G. R. A. Single nucleotide polymorphism calling and imputation strategies for cost-effective genotyping in a tropical maize breeding program. Crop Science, v. 60, n. 6, p. 3066-3082, 2020.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: A - 1 |
| Biblioteca(s): Embrapa Milho e Sorgo. |
| |
| 15. | | KRAUSE, M. D.; DIAS, K. O. das G.; SANTOS, J. P. R. dos; OLIVEIRA, A. A. de; GUIMARAES, L. J. M.; PASTINA, M. M.; MARGARIDO, G. R. A.; GARCIA, A. A. F. Boosting predictive ability of tropical maize hybrids via genotype-by-environment interaction under multivariate GBLUP models. Crop Science, v. 60, n. 6, p. 3049-3065, 2020.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: A - 1 |
| Biblioteca(s): Embrapa Milho e Sorgo. |
| |
| 16. | | TREVISOLI, P. A.; MOREIRA, G. C. M.; BOSCHIERO, C.; CESAR, A. S. M.; PETRINI, J.; MARGARIDO, G. R. A.; LEDUR, M. C.; MOURÃO, G. B.; GARRICK, D.; COUTINHO, L. L. A missense mutation in the MYBPH gene is associated with abdominal fat traits in meat-type chickens. Frontiers in Genetics, v. 12, n. 698163, 2021.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: A - 1 |
| Biblioteca(s): Embrapa Suínos e Aves. |
| |
| 17. | | OLIVEIRA, E. J. de; GARCIA, A. A. F.; MUNHOZ, C. de F.; MARGARIDO, G. R. A.; CONSOLI, L.; MATTA, F. de P.; MORAES, M. C. de; ZUCCHI, M. I.; FUNGARO, M. H. P.; VIEIRA, M. L. C. Integração de mapas genético-moleculares de maracujá-amarelo. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE MELHORAMENTO DE PLANTAS, 4., 2007, São Lourenço. São Lourenço:[s.n.], 2007.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso / Nota Técnica |
| Biblioteca(s): Embrapa Mandioca e Fruticultura. |
| |
| 18. | | OLIVEIRA, E. J.; VIEIRA, M. L. C.; GARCIA, A. A. F.; MUNHOZ, C. F.; MARGARIDO, G. R. A.; CONSOLI, L.; MATTA, F. P.; MORAES, M. C.; ZUCCHI, M. I.; FUNGARO, M. H. P. An integrated molecular map yellow passion fruit based on simultaneous maximum-likelihood estimation of linkage and linkage phases. Journal of the American Society Horticultural Science, Mount Vernon, v. 133, n. 1, p. 35-41, jan. 2008. il.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: Internacional - A |
| Biblioteca(s): Embrapa Mandioca e Fruticultura. |
| |
| 19. | | OLIVEIRA, A. A. de; PASTINA, M. M.; SOUZA, V. F. de; PARRELLA, R. A. da C.; NODA, R. W.; SIMEONE, M. L. F.; SCHAFFERT, R. E.; MAGALHAES, J. V. de; DAMASCENO, C. M. B.; MARGARIDO, G. R. A. Genomic prediction applied to high-biomass sorghum for bioenergy production. Molecular Breeding, v. 38, n. 49, p. 1-16, 2018.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: A - 1 |
| Biblioteca(s): Embrapa Milho e Sorgo. |
| |
| 20. | | OLIVEIRA, A. A. de; RESENDE JÚNIOR, M. F. R.; FERRÃO, L. F. V.; AMADEU, R. R.; GUIMARAES, L. J. M.; GUIMARÃES, C. T.; PASTINA, M. M.; MARGARIDO, G. R. A. Genomic prediction applied to multiple traits and environments in second season maize hybrids. Heredity, v. 125, n. 1/2, p. 60-72, 2020.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: A - 1 |
| Biblioteca(s): Embrapa Milho e Sorgo. |
| |
| Registros recuperados : 23 | |
|
| Nenhum registro encontrado para a expressão de busca informada. |
|
|
